Microbiology ======================================== .. contents:: Modules included in this section :local: :depth: 1 .. automodule:: neatseq_flow_modules.microbiology.CARD_RGI .. automodule:: neatseq_flow_modules.Liron.cgMLST_and_MLST_typing_module.cgMLST_and_MLST_typing .. automodule:: neatseq_flow_modules.Liron.Roary_module.Roary .. automodule:: neatseq_flow_modules.Liron.Snippy_module.Snippy .. automodule:: neatseq_flow_modules.Liron.Gubbins_module.Gubbins .. automodule:: neatseq_flow_modules.Liron.Tree_plot_module.Tree_plot